Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms