Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik1Q60934 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik1Q60934 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms