Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Neurod1Q60867 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Neurod1Q60867 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms