Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mkrn3Q60764 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms