Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ItgaeQ60677 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms