Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr1h2Q60644 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms