Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Prdm1Q60636 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Prdm1Q60636 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms