Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms