Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sco1Q5SUC9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sco1Q5SUC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms