Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d1Q5SSN7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms