Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TefmQ5SSK3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms