Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Utp18Q5SSI6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms