Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
1810065E05RikQ5NC41 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms