Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp28Q5I043 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp28Q5I043 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp28Q5I043 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp28Q5I043 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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