Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SynaQ5G5D5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms