Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ecm2Q5FW85 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecm2Q5FW85 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms