Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrc3Q5DU56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc3Q5DU56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms