Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms