Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GpkowQ56A08 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpkowQ56A08 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms