Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prune2Q52KR3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prune2Q52KR3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms