Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc84Q4VA36 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc84Q4VA36 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms