Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3lQ4KL14 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms