Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Esf1Q3V1V3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Esf1Q3V1V3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms