Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3V0E1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms