Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4933416C03RikQ3V063 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms