Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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