Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnaaf3Q3UYV8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms