Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms