Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn13Q3UW68 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Capn13Q3UW68 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms