Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb48Q3UW22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb48Q3UW22 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms