Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap1Q3UUV5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap1Q3UUV5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms