Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm10Q3UTQ7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm10Q3UTQ7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms