Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fchsd2Q3USJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fchsd2Q3USJ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms