Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TceancQ3US16 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TceancQ3US16 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms