Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc190Q3URK1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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