Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms