Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rbm20Q3UQS8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbm20Q3UQS8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbm20Q3UQS8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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