Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms