Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbsponQ3UPR9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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