Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms