Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nhlrc4Q3UP44 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms