Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem253Q3UNB8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms