Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fhdc1Q3ULZ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fhdc1Q3ULZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms