Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctsll3Q3ULP7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctsll3Q3ULP7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms