Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CrxosQ3UL53 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CrxosQ3UL53 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms