Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E330014E10RikQ3UL33 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E330014E10RikQ3UL33 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms