Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ceacam5Q3UKK2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ceacam5Q3UKK2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms