Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx27Q3UHD6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx27Q3UHD6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms