Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rreb1Q3UH06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rreb1Q3UH06 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms