Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc58Q3UGP9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc58Q3UGP9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms